Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn5Q9WU28 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms