Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp18Q9WTV6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms