Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU0

Phf2, Lysine-specific demethylase PHF2, mousemouse

Predictions only

Length 1,096 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf2Q9WTU0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf2Q9WTU0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf2Q9WTU0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf2Q9WTU0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf2Q9WTU0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf2Q9WTU0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf2Q9WTU0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf2Q9WTU0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf2Q9WTU0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf2Q9WTU0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf2Q9WTU0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf2Q9WTU0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf2Q9WTU0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf2Q9WTU0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf2Q9WTU0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf2Q9WTU0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf2Q9WTU0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf2Q9WTU0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf2Q9WTU0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf2Q9WTU0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf2Q9WTU0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf2Q9WTU0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf2Q9WTU0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Phf2Q9WTU0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Phf2Q9WTU0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Phf2Q9WTU0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Phf2Q9WTU0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Phf2Q9WTU0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Phf2Q9WTU0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Phf2Q9WTU0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf2Q9WTU0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Phf2Q9WTU0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Phf2Q9WTU0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf2Q9WTU0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf2Q9WTU0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf2Q9WTU0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms