Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam50bQ9WTJ8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam50bQ9WTJ8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms