Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PplQ9R269 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PplQ9R269 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PplQ9R269 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PplQ9R269 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PplQ9R269 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PplQ9R269 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PplQ9R269 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PplQ9R269 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PplQ9R269 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PplQ9R269 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PplQ9R269 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PplQ9R269 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PplQ9R269 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PplQ9R269 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PplQ9R269 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PplQ9R269 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PplQ9R269 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PplQ9R269 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PplQ9R269 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PplQ9R269 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PplQ9R269 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PplQ9R269 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PplQ9R269 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PplQ9R269 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PplQ9R269 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PplQ9R269 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PplQ9R269 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PplQ9R269 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PplQ9R269 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PplQ9R269 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PplQ9R269 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PplQ9R269 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PplQ9R269 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PplQ9R269 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PplQ9R269 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PplQ9R269 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PplQ9R269 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PplQ9R269 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PplQ9R269 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PplQ9R269 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PplQ9R269 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PplQ9R269 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PplQ9R269 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PplQ9R269 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PplQ9R269 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PplQ9R269 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PplQ9R269 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PplQ9R269 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PplQ9R269 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PplQ9R269 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PplQ9R269 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PplQ9R269 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PplQ9R269 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PplQ9R269 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PplQ9R269 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PplQ9R269 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms