Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim3Q9R1R2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim3Q9R1R2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim3Q9R1R2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim3Q9R1R2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim3Q9R1R2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim3Q9R1R2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim3Q9R1R2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim3Q9R1R2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim3Q9R1R2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim3Q9R1R2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim3Q9R1R2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim3Q9R1R2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim3Q9R1R2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim3Q9R1R2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trim3Q9R1R2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms