Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Htra1Q9R118 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Htra1Q9R118 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Htra1Q9R118 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Htra1Q9R118 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Htra1Q9R118 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Htra1Q9R118 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Htra1Q9R118 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htra1Q9R118 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htra1Q9R118 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htra1Q9R118 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms