Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Tmed2Q9R0Q3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmed2Q9R0Q3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmed2Q9R0Q3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmed2Q9R0Q3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmed2Q9R0Q3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmed2Q9R0Q3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmed2Q9R0Q3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmed2Q9R0Q3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmed2Q9R0Q3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmed2Q9R0Q3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmed2Q9R0Q3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmed2Q9R0Q3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms