Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L1

Hsf4, Heat shock factor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsf4Q9R0L1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hsf4Q9R0L1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms