Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zeb2Q9R0G7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms