Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Plod1Q9R0E2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms