Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Wdr54Q9R0D8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms