Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vav3Q9R0C8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vav3Q9R0C8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms