Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkab1Q9R078 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkab1Q9R078 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms