Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Npas3Q9QZQ0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Npas3Q9QZQ0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms