Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Ercc4Q9QZD4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ercc4Q9QZD4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ercc4Q9QZD4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ercc4Q9QZD4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Ercc4Q9QZD4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ercc4Q9QZD4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Ercc4Q9QZD4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Ercc4Q9QZD4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ercc4Q9QZD4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ercc4Q9QZD4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ercc4Q9QZD4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
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Ercc4Q9QZD4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Ercc4Q9QZD4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ercc4Q9QZD4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ercc4Q9QZD4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Ercc4Q9QZD4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Ercc4Q9QZD4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ercc4Q9QZD4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ercc4Q9QZD4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ercc4Q9QZD4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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Ercc4Q9QZD4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Ercc4Q9QZD4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Ercc4Q9QZD4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ercc4Q9QZD4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Ercc4Q9QZD4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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Ercc4Q9QZD4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ercc4Q9QZD4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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