Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hacd1Q9QY80 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hacd1Q9QY80 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hacd1Q9QY80 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hacd1Q9QY80 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hacd1Q9QY80 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hacd1Q9QY80 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hacd1Q9QY80 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hacd1Q9QY80 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hacd1Q9QY80 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hacd1Q9QY80 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hacd1Q9QY80 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hacd1Q9QY80 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd1Q9QY80 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd1Q9QY80 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd1Q9QY80 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd1Q9QY80 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd1Q9QY80 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hacd1Q9QY80 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms