Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irx4Q9QY61 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Irx4Q9QY61 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx4Q9QY61 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms