Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr2e3Q9QXZ7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr2e3Q9QXZ7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms