Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dkk3Q9QUN9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms