Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc2lQ9JME7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc2lQ9JME7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms