Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Sfmbt1Q9JMD1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms