Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms