Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Cabp1Q9JLK7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cabp1Q9JLK7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cabp1Q9JLK7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cabp1Q9JLK7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cabp1Q9JLK7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cabp1Q9JLK7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cabp1Q9JLK7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Cabp1Q9JLK7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cabp1Q9JLK7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Cabp1Q9JLK7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cabp1Q9JLK7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cabp1Q9JLK7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cabp1Q9JLK7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cabp1Q9JLK7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cabp1Q9JLK7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cabp1Q9JLK7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cabp1Q9JLK7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cabp1Q9JLK7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Cabp1Q9JLK7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Cabp1Q9JLK7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cabp1Q9JLK7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cabp1Q9JLK7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cabp1Q9JLK7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cabp1Q9JLK7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Cabp1Q9JLK7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cabp1Q9JLK7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cabp1Q9JLK7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cabp1Q9JLK7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cabp1Q9JLK7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cabp1Q9JLK7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cabp1Q9JLK7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cabp1Q9JLK7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cabp1Q9JLK7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cabp1Q9JLK7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cabp1Q9JLK7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cabp1Q9JLK7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cabp1Q9JLK7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cabp1Q9JLK7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cabp1Q9JLK7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
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