Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
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