Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gde1Q9JL56 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gde1Q9JL56 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms