Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnot9Q9JKY0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot9Q9JKY0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms