Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Upk3aQ9JKX8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms