Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmx1aQ9JKU8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmx1aQ9JKU8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmx1aQ9JKU8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmx1aQ9JKU8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmx1aQ9JKU8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmx1aQ9JKU8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lmx1aQ9JKU8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lmx1aQ9JKU8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms