Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Habp4Q9JKS5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms