Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ldb3Q9JKS4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms