Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx5Q9JKQ4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx5Q9JKQ4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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