Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AtrQ9JKK8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms