Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrpl39Q9JKF7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms