Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trem3Q9JKE1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trem3Q9JKE1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trem3Q9JKE1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trem3Q9JKE1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trem3Q9JKE1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trem3Q9JKE1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trem3Q9JKE1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trem3Q9JKE1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trem3Q9JKE1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trem3Q9JKE1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trem3Q9JKE1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trem3Q9JKE1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trem3Q9JKE1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trem3Q9JKE1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trem3Q9JKE1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trem3Q9JKE1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trem3Q9JKE1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trem3Q9JKE1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trem3Q9JKE1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trem3Q9JKE1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trem3Q9JKE1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms