Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Scamp5Q9JKD3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scamp5Q9JKD3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scamp5Q9JKD3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms