Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Uchl3Q9JKB1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Uchl3Q9JKB1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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