Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
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Tuba8Q9JJZ2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Tuba8Q9JJZ2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tuba8Q9JJZ2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Tuba8Q9JJZ2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
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Tuba8Q9JJZ2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Tuba8Q9JJZ2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Tuba8Q9JJZ2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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