Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gfra4Q9JJT2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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