Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIZ0

Cml1, Probable N-acetyltransferase CML1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml1Q9JIZ0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cml1Q9JIZ0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cml1Q9JIZ0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cml1Q9JIZ0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cml1Q9JIZ0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cml1Q9JIZ0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cml1Q9JIZ0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cml1Q9JIZ0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cml1Q9JIZ0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cml1Q9JIZ0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cml1Q9JIZ0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cml1Q9JIZ0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cml1Q9JIZ0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cml1Q9JIZ0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cml1Q9JIZ0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cml1Q9JIZ0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cml1Q9JIZ0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cml1Q9JIZ0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cml1Q9JIZ0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cml1Q9JIZ0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cml1Q9JIZ0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms