Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cacna1fQ9JIS7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cacna1fQ9JIS7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna1fQ9JIS7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms