Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA1

Lgi1, Leucine-rich glioma-inactivated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi1Q9JIA1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lgi1Q9JIA1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lgi1Q9JIA1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lgi1Q9JIA1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lgi1Q9JIA1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lgi1Q9JIA1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lgi1Q9JIA1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lgi1Q9JIA1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lgi1Q9JIA1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lgi1Q9JIA1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lgi1Q9JIA1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lgi1Q9JIA1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lgi1Q9JIA1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lgi1Q9JIA1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lgi1Q9JIA1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lgi1Q9JIA1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lgi1Q9JIA1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lgi1Q9JIA1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lgi1Q9JIA1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lgi1Q9JIA1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lgi1Q9JIA1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lgi1Q9JIA1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lgi1Q9JIA1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lgi1Q9JIA1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lgi1Q9JIA1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lgi1Q9JIA1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lgi1Q9JIA1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lgi1Q9JIA1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lgi1Q9JIA1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lgi1Q9JIA1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms