Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RabggtaQ9JHK4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RabggtaQ9JHK4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RabggtaQ9JHK4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
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