Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Rb1cc1Q9ESK9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Rb1cc1Q9ESK9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Rb1cc1Q9ESK9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Rb1cc1Q9ESK9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Rb1cc1Q9ESK9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Rb1cc1Q9ESK9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Rb1cc1Q9ESK9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Rb1cc1Q9ESK9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Rb1cc1Q9ESK9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Rb1cc1Q9ESK9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
Rb1cc1Q9ESK9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Rb1cc1Q9ESK9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Rb1cc1Q9ESK9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Rb1cc1Q9ESK9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
Rb1cc1Q9ESK9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Rb1cc1Q9ESK9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Rb1cc1Q9ESK9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Rb1cc1Q9ESK9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Rb1cc1Q9ESK9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Rb1cc1Q9ESK9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Rb1cc1Q9ESK9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Rb1cc1Q9ESK9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Rb1cc1Q9ESK9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Rb1cc1Q9ESK9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Rb1cc1Q9ESK9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Rb1cc1Q9ESK9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Rb1cc1Q9ESK9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Rb1cc1Q9ESK9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Rb1cc1Q9ESK9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Rb1cc1Q9ESK9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Rb1cc1Q9ESK9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Rb1cc1Q9ESK9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Rb1cc1Q9ESK9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Rb1cc1Q9ESK9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Rb1cc1Q9ESK9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Rb1cc1Q9ESK9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Rb1cc1Q9ESK9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Rb1cc1Q9ESK9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Rb1cc1Q9ESK9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Rb1cc1Q9ESK9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Rb1cc1Q9ESK9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Rb1cc1Q9ESK9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Rb1cc1Q9ESK9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Rb1cc1Q9ESK9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Rb1cc1Q9ESK9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Rb1cc1Q9ESK9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Rb1cc1Q9ESK9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Rb1cc1Q9ESK9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Rb1cc1Q9ESK9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Rb1cc1Q9ESK9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Rb1cc1Q9ESK9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Rb1cc1Q9ESK9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Rb1cc1Q9ESK9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Rb1cc1Q9ESK9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Rb1cc1Q9ESK9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Rb1cc1Q9ESK9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Rb1cc1Q9ESK9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Rb1cc1Q9ESK9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rb1cc1Q9ESK9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Rb1cc1Q9ESK9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rb1cc1Q9ESK9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Rb1cc1Q9ESK9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Rb1cc1Q9ESK9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.35
Rb1cc1Q9ESK9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
Rb1cc1Q9ESK9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Rb1cc1Q9ESK9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
Rb1cc1Q9ESK9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC36■■■■□ 3.35
Rb1cc1Q9ESK9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC36■■■■□ 3.35
Rb1cc1Q9ESK9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Rb1cc1Q9ESK9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Rb1cc1Q9ESK9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Rb1cc1Q9ESK9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Rb1cc1Q9ESK9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
Rb1cc1Q9ESK9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Rb1cc1Q9ESK9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Rb1cc1Q9ESK9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Rb1cc1Q9ESK9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Rb1cc1Q9ESK9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Rb1cc1Q9ESK9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Rb1cc1Q9ESK9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms