Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK3

Capn10, Calpain-10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn10Q9ESK3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Capn10Q9ESK3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn10Q9ESK3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms