Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SelenofQ9ERR7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms