Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim54Q9ERP3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim54Q9ERP3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trim54Q9ERP3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim54Q9ERP3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim54Q9ERP3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim54Q9ERP3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim54Q9ERP3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim54Q9ERP3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim54Q9ERP3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim54Q9ERP3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim54Q9ERP3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim54Q9ERP3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Trim54Q9ERP3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Trim54Q9ERP3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trim54Q9ERP3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim54Q9ERP3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim54Q9ERP3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim54Q9ERP3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Trim54Q9ERP3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim54Q9ERP3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Trim54Q9ERP3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim54Q9ERP3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim54Q9ERP3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim54Q9ERP3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim54Q9ERP3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim54Q9ERP3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim54Q9ERP3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim54Q9ERP3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim54Q9ERP3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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