Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc28a3Q9ERH8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc28a3Q9ERH8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc28a3Q9ERH8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc28a3Q9ERH8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms