Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tfcp2Q9ERA0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tfcp2Q9ERA0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tfcp2Q9ERA0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms