Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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